Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NF1P21359 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NF1P21359 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NF1P21359 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NF1P21359 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NF1P21359 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NF1P21359 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NF1P21359 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms