Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMNB1P20700 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms