Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF4P18085 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF4P18085 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF4P18085 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF4P18085 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARF4P18085 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARF4P18085 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARF4P18085 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARF4P18085 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARF4P18085 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARF4P18085 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARF4P18085 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARF4P18085 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms