Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN1P18031 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN1P18031 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms