Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNB2P17787 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB2P17787 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB2P17787 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB2P17787 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB2P17787 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB2P17787 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB2P17787 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB2P17787 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms