Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYN1P17600 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYN1P17600 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYN1P17600 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYN1P17600 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYN1P17600 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms