Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EPCAMP16422 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPCAMP16422 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms