Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTLA4P16410 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTLA4P16410 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms