Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCL5P13501 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL5P13501 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL5P13501 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL5P13501 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCL5P13501 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCL5P13501 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCL5P13501 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCL5P13501 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms