Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDH1P12830 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDH1P12830 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDH1P12830 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDH1P12830 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms