Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL11A1P12107 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL11A1P12107 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms