Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNMA6AP0CW24 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms