Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C4AP0C0L4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C4AP0C0L4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms