Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PKHD1P08F94 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKHD1P08F94 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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