Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MGPP08493 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MGPP08493 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MGPP08493 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGPP08493 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGPP08493 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MGPP08493 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MGPP08493 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms