Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EIF4EP06730 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EIF4EP06730 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms