Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALB1P05937 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALB1P05937 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALB1P05937 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALB1P05937 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALB1P05937 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALB1P05937 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALB1P05937 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALB1P05937 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALB1P05937 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALB1P05937 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALB1P05937 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALB1P05937 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALB1P05937 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALB1P05937 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALB1P05937 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms