Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HLA-HP01893 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HLA-HP01893 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms