Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDHAP00338 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHAP00338 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHAP00338 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHAP00338 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHAP00338 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHAP00338 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHAP00338 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHAP00338 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHAP00338 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHAP00338 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHAP00338 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms