Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZBED1O96006 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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