Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNTO95613 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNTO95613 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNTO95613 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNTO95613 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNTO95613 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCNTO95613 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCNTO95613 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNTO95613 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNTO95613 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNTO95613 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNTO95613 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNTO95613 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNTO95613 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNTO95613 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNTO95613 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNTO95613 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNTO95613 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms