Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN9O95484 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN9O95484 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN9O95484 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN9O95484 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN9O95484 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN9O95484 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN9O95484 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms