Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB6O95452 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB6O95452 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB6O95452 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB6O95452 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB6O95452 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB6O95452 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB6O95452 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJB6O95452 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB6O95452 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB6O95452 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB6O95452 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB6O95452 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB6O95452 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB6O95452 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB6O95452 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB6O95452 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB6O95452 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB6O95452 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms