Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEBLO76041 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEBLO76041 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEBLO76041 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEBLO76041 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEBLO76041 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEBLO76041 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms