Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSO75390 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSO75390 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSO75390 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSO75390 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSO75390 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSO75390 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSO75390 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSO75390 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSO75390 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSO75390 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSO75390 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSO75390 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms