Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNND1O60716 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND1O60716 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms