Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN3BO60391 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN3BO60391 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN3BO60391 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms