Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTSS1O43312 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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