Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SART1O43290 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SART1O43290 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SART1O43290 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SART1O43290 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SART1O43290 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SART1O43290 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SART1O43290 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SART1O43290 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SART1O43290 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SART1O43290 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SART1O43290 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SART1O43290 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SART1O43290 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SART1O43290 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SART1O43290 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SART1O43290 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SART1O43290 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SART1O43290 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SART1O43290 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SART1O43290 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms