Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM2O43147 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms