Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EBAG9O00559 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBAG9O00559 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms