Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
J3QKU1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
J3QKU1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3QKU1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3QKU1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
J3QKU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3QKU1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3QKU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms