Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E9PBE3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E9PBE3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E9PBE3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E9PBE3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PBE3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PBE3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PBE3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PBE3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PBE3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PBE3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PBE3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E9PBE3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E9PBE3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E9PBE3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms