Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms