Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB1P1B2RPK0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms