Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms