Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF839A8K0R7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms