Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ3A6PVS8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms