Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF316A6NFI3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF316A6NFI3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms