Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCCD1A6NED2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RCCD1A6NED2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCCD1A6NED2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms