Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA3AA6NCI4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms