Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PSDA5PKW4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSDA5PKW4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PSDA5PKW4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms