Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FRMD3A2A2Y4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FRMD3A2A2Y4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms