Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0U1RQJ8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms