Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G6

TRBV10-3, T-cell receptor beta variable 10-3 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TRBV10-3A0A0K0K1G6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TRBV10-3A0A0K0K1G6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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