Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A0D9SFI3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0D9SFI3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms