Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr1h3Q9Z0Y9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr1h3Q9Z0Y9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr1h3Q9Z0Y9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nr1h3Q9Z0Y9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Nr1h3Q9Z0Y9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nr1h3Q9Z0Y9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nr1h3Q9Z0Y9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nr1h3Q9Z0Y9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr1h3Q9Z0Y9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr1h3Q9Z0Y9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nr1h3Q9Z0Y9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr1h3Q9Z0Y9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr1h3Q9Z0Y9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr1h3Q9Z0Y9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr1h3Q9Z0Y9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr1h3Q9Z0Y9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nr1h3Q9Z0Y9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr1h3Q9Z0Y9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nr1h3Q9Z0Y9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nr1h3Q9Z0Y9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nr1h3Q9Z0Y9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nr1h3Q9Z0Y9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nr1h3Q9Z0Y9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Nr1h3Q9Z0Y9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nr1h3Q9Z0Y9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms