Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FAM50BQ9Y247 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FAM50BQ9Y247 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM50BQ9Y247 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM50BQ9Y247 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM50BQ9Y247 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM50BQ9Y247 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM50BQ9Y247 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM50BQ9Y247 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms