Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD4AQ9UPU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD4AQ9UPU9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD4AQ9UPU9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD4AQ9UPU9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD4AQ9UPU9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD4AQ9UPU9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SAMD4AQ9UPU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD4AQ9UPU9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMD4AQ9UPU9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD4AQ9UPU9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAMD4AQ9UPU9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SAMD4AQ9UPU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD4AQ9UPU9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD4AQ9UPU9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD4AQ9UPU9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD4AQ9UPU9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD4AQ9UPU9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD4AQ9UPU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms