Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
HERC5Q9UII4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HERC5Q9UII4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HERC5Q9UII4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HERC5Q9UII4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HERC5Q9UII4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HERC5Q9UII4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
HERC5Q9UII4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HERC5Q9UII4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HERC5Q9UII4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HERC5Q9UII4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HERC5Q9UII4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HERC5Q9UII4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HERC5Q9UII4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HERC5Q9UII4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HERC5Q9UII4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HERC5Q9UII4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HERC5Q9UII4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HERC5Q9UII4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HERC5Q9UII4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms